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Tag Archive 'Bioinformatik'

Riesige Phylogenetische Stammbäume

Bastian sagt:
Seit Darwin seine Theorie zur Evolution der Arten propagiert hat gibt es Bemühungen den kompletten Stammbaum der Arten abzubilden. Auch wenn man kein Evolutionsbiologe ist kann man sich vielleicht noch vorstellen dass dieses Problem nicht gerade einfach zu lösen ist.
Deshalb verwendet man zur Rekonstruktion von phylogenetischen Bäumen meist nur eine kleine Auswahl an Arten [...]

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Inzucht im Adel

Bastian sagt:
In unserem westlichem Kulturraum ist Inzucht ein Tabu-Thema und das Praktizieren wird öffentlich gebrandmarkt. Anders sieht es da beispielsweise in teilen von Afrika und Asien aus wo dieses Phänomenen weiter verbreitet ist. Doch auch in der westlichen Geschichte lassen sich Ausnahmen finden. Beispielsweise in der Geschichte verschiedener Königshäuser in Europa.
So auch bei den Habsburgern [...]

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Ein Genombrowser für jeden

Bastian sagt:
Für viele Biologen sind Genombrowser ein praktisches Werkzeug, nicht nur wenn man selbst an ganzen Genomen arbeitet, sondern auch zu sehen in welchem Zusammenhang die eigene Arbeit im Genom zu sehen ist. Ein beliebtes Tool dafür ist GBrowse, ein Beispiel wie der gut konfigurierte Browser aussehen kann ist die FlyBase in der das Genom [...]

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Bioinformatiker und die Sprache

Bastian sagt:
Jeder der die englische Sprache erlernt hat dürfte sich über die blöden unregelmässigen Verben geärgert haben die es einfach auswendig zu lernen galt. Bei regelmässigen Verben werden Simple Past und Past Participle einfach durch anhängen von -ed gebildet, wie die Reihe talk/talked/talked während die unregelmässigen Verben scheinbar keinen Regeln folgen (go/went).
Das dürfte zwar nicht [...]

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Altersbestimmung von HIV

Bastian sagt:
Die meisten Leute denken bei den Anfängen von HIV sicherlich an die Welle von Infektionen in den 80ern wo sich der Virus erstmals einer breiteren Masse von Menschen zeigte. Weniger bekannt ist es da schon, dass die älteste, nachgewiesene Infektion mit HIV von 1959 stammt.
Doch wie alt ist das HI-Virus denn nun wirklich? Dieser [...]

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Übersichtlich

Woran Philipp & ich gerade arbeiten.
Linus sagt:
Und hier woran ich diesen Sommer (im weiteren Sinne) gearbeitet habe:

Mehr gibt es (vielleicht) davon zu lesen, wenn (falls) es peer-reviewed wurde…

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Python für Biologen

Philipp und ich machen zur Zeit bei den Münsteraner Bioinformatikern ein kleines Sommerprojekt und im Zuge dessen wir beide auch gerade Python zu lernen. Was gar nicht so einfach ist, bislang haben wir uns hauptsächlich mit try & error über Wasser gehalten und uns dafür auch gar nicht so schlecht geschlagen, denn unsere Vorkenntnisse bestanden [...]

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